Formé à la musique classique et au jazz au conservatoire de Marseille, Jean-Marc Padovani est un saxophoniste et un compositeur très sollicité. Tout au long de sa carrière il a multiplié les rencontres et collaborations avec les meilleurs musiciens de la scène européenne et internationale, comme Enrico Rava, Paul Motian, David Liebman, Louis Sclavis, Bennie Wallace, Albert Mangelsdorf, Jean-Marie Machado, Jean-François Jenny-Clarke, Paul Motian, Enzo Cormann… Depuis, les différentes créations qu'il propose se font souvent l'écho de son attachement aux musiques traditionnelles et au théâtre. Il a dirigé pendant une dizaine d’années le festival « Assier dans tous ses états », véritable vitrine de la création contemporaine en Midi-Pyrénées.
Il a enregistré une vingtaine d’albums sous son nom dont le dernier sous le label Naïve jazz est un vibrant hommage au batteur récemment disparu, Paul Motian. Il enseigne l’improvisation à l’université Jean Jaurès de Toulouse.